3Dセキュアを導入していてもチャージバックが発生する可能性は十分にあります。
3Dセキュアで抑制ができるのは第三者のなりすましによる、いわゆる「不正利用」のみです。
そのため、「金額が表示されているものと違った」「違う商品が届いた」「二重に決済された」など、その他の理由で発生するチャージバックは3Dセキュアでは抑制ができません。
対応者：PAY.JP Support
1週間以上前に更新こちらの回答で解決しましたか？
3Dセキュアを導入していてもチャージバックが発生する可能性は十分にあります。
3Dセキュアで抑制ができるのは第三者のなりすましによる、いわゆる「不正利用」のみです。
そのため、「金額が表示されているものと違った」「違う商品が届いた」「二重に決済された」など、その他の理由で発生するチャージバックは3Dセキュアでは抑制ができません。